研究报告

沙柳 SpsTAC2 基因克隆、生物信息学及组织特异表达分析  

袁梦如 , 杨杨 , 张磊 , 贺玉娇 , 金娜 , 杨海峰
内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 010018
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年06月19日    接受日期: 2018年07月24日    发表日期: 2019年05月09日
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摘要

TAC 基因隶属 IGT 基因家族,该基因家族主要参与植物分枝角度的调控,目前国内外针对木本植物中 TAC 基因的研究较少。为了获得沙柳中的 TAC 基因并对该序列进行初步分析,本研究用同源克隆技术在沙柳中克隆得到长度为 783 bp CDS 序列并命名为 SpsTAC2 基因,对其进行生物信息学及组织特异性表达分析。结果分析表明,该基因编码 260 个氨基酸,为亲水性蛋白,未发现跨膜结构域,无信号肽区域,亚细胞定位预测在细胞核,基因内含有 IGT 基因家族典型结构域。系统进化树将 SpsTAC2 氨基酸序列与杨、柳位于第二条染色体上的 TAC-like 基因所编码氨基酸序列聚为一类。RT-qPCR 结果表明,该基因在成熟叶表达量最高,其次是韧皮部,在根部几乎不表达。从沙柳中成功克隆出了调控分枝角度的 IGT 基因家族的SpsTAC2 基因,推测该基因的主要作用部位可能在成熟叶、茎中。沙柳 SpsTAC2 基因的研究为 IGT 基因家族研究及沙柳育种工作提供了理论依据。

关键词
沙柳;分枝角度;TAC;生物信息学分析;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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